Die drei Kompetenzcluster adressieren unterschiedliche Anwendungsfelder von Anonymisierungstechnologien. In jedem der Cluster arbeiten mehrere Projektpartner gemeinsam an Lösungen. Je eine Institution koordiniert den Forschungsverbund. Die Kompetenzcluster binden alle relevanten Stakeholder aus Wissenschaft, Wirtschaft und Gesellschaft partizipativ ein. Dies soll eine Forschung und Entwicklung in realen oder realitätsnahen Nutzungssituationen ermöglichen.
 Anonymisierung für medizinische Anwendungen​
Anonymisierung für vernetze Mobilitätssysteme​
Anonymisierung persönlicher Gesundheitsdaten durch Erzeugung digitaler Avatare in Medizin und Pflege
Komplementär zu den Clustern fördert das BMFTR Forschungsprojekte, die innovative und effiziente neue Verfahren, Methoden und Technologien entwickeln, um die datenschutzkonforme, anonymisierte Bereitstellung und Nutzung von Daten zu fördern.